靈芝抗癌機理較為深奧，學術界也一直未有定論，但以下三種機理研究似有一定的代表性。

    免疫功能論
   
    即通過增強機體免疫功能而實現的，這是已被許多專家學者所證實的。據林志彬教授實驗研究認為，靈芝提取物（主要是多糖、三萜類），能提高機體的非特異性免疫功能，增強機體體液免疫功能，增強機體細胞免疫功能，促進免疫細胞因子的產生，增強淋巴細雞蛋的DNA多聚酶a活性等，達到預防癌癥發生模式、初期治療模式、后期治療模式中產生抑瘤效果。

    林志彬教授等，曾對靈芝所含的主要有效成份的抗腫瘤機理進行了系統的實驗研究，發現靈芝能增強巨噬細胞的吞噬功能，促進淋巴細胞增殖，增強T殺傷細胞的細胞毒作用，促進細胞因子及腫瘤壞死因子的生成及其基因表達。實驗結果均指出，靈芝及其有效成份確無直接細胞毒作用，但可通過增強機體抗腫瘤免疫力而間接抑制腫效力細胞生長或誘導腫瘤細胞凋亡，并因此發揮抗腫瘤作用。

    端粒酶論

    這是最近幾年由上海藥物研究所實驗研究后提出的一種新的靈芝抗癌機理試驗的結果。他們認為：“正常細胞和癌細胞的染色體未端都有一段DNA，俗稱端粒。正常細胞每分裂一次，其端粒就要縮短一些，直到分裂耗盡衰亡。癌細胞卻具有端粒酶，保護端粒在癌細胞分裂時不受損耗，從而使癌細胞有了無限分裂增殖的能力。”

    為了尋找破壞端粒酶的方法，他們以靈芝制劑為試驗藥品，結果發現，靈芝提取物能造成癌細胞端粒失去活性，促使癌細胞在分裂后自然凋亡。這些研究和實驗揭開了靈芝新的抗癌機理，從根本上揭示了靈芝提取物奇特藥用效果的一個重要方面，即某種外力如果能夠 對端粒酶進行有效破壞，就可以使癌細胞因失去保護而全線崩潰，這就是靈芝提取物能在眾多患者身上不斷發生奇跡的本質原因所在。當然，這種新的理論還需要不斷加以研究、證實、完善。

    促分化論

    這是大連醫科大學張耀錚教授研究的課題，研究揭示癌細胞在促分化劑作用下可以重新向正常細胞分化、逆轉，開辟了一條非殺傷性治療腫瘤的新思路、新途徑。該項研究以腫瘤標志酶、分化酶、環一腺苷酸（CAMP）等作為觀察指標，首次發現靈芝提取物H22 腹水肝癌細胞及Hca-F23/CI-16A3 肝癌細胞/肝癌組織具有促分化而使其向正常逆轉的作用。這是靈芝抗腫瘤機理又一種新的理論，對于發揚靈芝這珍貴的中藥材有著重要的理論意義及廣闊前景，目前該項研究獲得了遼寧省科技進步獎。

    北京某部軍醫廖開瑛教授在他《中醫治癌新論》的專著中提出促使癌細胞逆轉為正常細胞的“扶正改邪”的治癌理論與張教授的促分化論有驚人的相似之原理。廖教授認為把扶患者體內正氣、恢復增強免疫功能為突破口，再通過人的免疫功能去抑制細胞，轉化癌細胞。據報導，廖教授十多年臨床實踐，在3791例中，臨床總有效率達80.4%、顯效率達67%。

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