尖銳濕疣發病部位主要在男女外生殖器和肛門部位，并且容易發生在溫暖、潮濕的皮膚粘膜處。少數發生在外生殖器和肛門以外的部位，如口腔等部位。在男性外生殖器部位的尖銳濕疣主要發生于包皮、冠狀溝、系帶和龜頭，其他部位有尿道口、尿道內、陰莖體、陰莖根、恥部、陰囊;在女性外生殖器部位的尖銳濕疣主要發生于大小陰唇、陰道口、后聯合，以及尿道口、隱窩、陰蒂、陰阜、陰道壁、宮頸等部位。肛門區的尖銳濕疣主要發生在肛門、肛門周圍、臀間區以及肛管和直腸。

　　在肛門外生殖器不同部位尖銳濕疣發病情況有所不同。有極少數患者尖銳濕疣損害發生在單一部位，而大多數患者尖銳濕疣損害發生在多個部位，如女性大小陰唇部位發生尖銳濕疣損害，也可伴有陰道壁、宮頸等多個部位發生尖銳濕疣損害，在外陰部發生尖銳濕疣損害者可有肛門部位發病等。Brown等報告男女性外生殖器疣的好發部位及頻率。其中肛門區發生頻率高低與是否肛交有關尚待進一步觀察。研究者觀察了肛周尖銳濕疣的發病情況，在708例尖銳濕疣中，肛周受累者188例，占總病例數的26.6%，其中男性104例，占男性患者的25.6%，女性84例，占女性患者的27.9%。外生殖器肛周均受累者116例，占總病例數的16.38%，其中男性41例，占男性患者的10.1%，女性75例，占女性患者的24.9%。外生殖器和肛門均受累者所占比例女性明顯高于男性，可能與女性外生殖器官更靠近肛門，使肛周的尖銳濕疣感染率增加有關。

 

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